Setgid

Выставляется командой chmod. Еще есть setuid флаг для файла, соответственно

Рут перешибает все все права Don't copy the files as root. Root will override any permissions.

chmod g+s

Для директорий этот флаг имеет совершенно другое значение, чем для файлов.

causes new files and subdirectories created within it to inherit its group ID, rather than the primary group ID of the user who created the file (the owner ID is never affected, only the group ID).